科研中频繁的需要用到Linux，熟练掌握Linux常用命令可以大大提高工作效率。 这里罗列Linux最常用的一些命令，快捷键，和一些小软件。
刚开始学习Linux只需掌握一组核心命令的使用。这些命令中的每一个都是一个 独立的程序，或者说软件。但是我们还是习惯称为程序，对应英文的Program 而不是Software，因为他们通常都是十分小巧，并且专干一件事。也不小小巧 这些小程序，因为通常可以将他们组合起来工作完成特定的工作。
我们在一个命令行提示符后面输入这些程序名字回车就是在运行这些程序了。 这个提供给我们输入命令的环境本身也是一个程序，它叫shell，也就是"外壳", 意思是包围在操作系统内核之外的一个环境，负责用户程序和内核直接的交互。 shell有不同的实现方式，但功能都是一样的: 给你一个输入命令的环境，并 在你键入命令并按下回车建之后执行这些命令。 最常见的shell是Bash，当然也有其他的，如csh，zsh等等。。。
这种靠输入命令按回车的工作方式就是Linux的标准使用方式，这种方式相 对于靠鼠标、菜单驱动的图形界面程序来说，有他独特的优势，但是也有 其弊端，比如对新手不太友好。但其实也没有想象那么困难。那些常用命令， 用熟了你也会感觉很自然，就像鼠标单击双击一样自然。
